В соответствии с подпунктом 1) пункта 2 статьи 342 Кодекса «О налогах и других обязательных платежах в бюджет» (далее – Налоговый кодекс), налоговые вычеты подлежат применению налоговым агентом по доходам, подлежащим налогообложению у источника выплаты, в порядке и случаях, предусмотренных статьей  343 Налогового кодекса.

В соответствии с положениями статьи 343 Налогового кодекса, налоговые вычеты, за исключением налоговых вычетов в виде обязательных пенсионных взносов, по взносам на обязательное социальное медицинское страхование и по пенсионным выплатам, указанным в пункте 1 статьи 345 Налогового кодекса, применяются налоговым агентом у источника выплаты на основании:

1) заявления физического лица о применении налоговых вычетов;

2) копий подтверждающих документов.

В случае если налоговые вычеты не применены налоговым агентом к доходу физического лица по причине обращения физического лица позже даты удержания  ИПН с такого дохода, то физическое лицо вправе представить налоговому агенту, производившему удержание ИПН с такого дохода, заявление и подтверждающие документы, на основании которых налоговый агент производит перерасчет доходов в пределах срока исковой давности - 3 лет.

Согласно подпункту 4) пункта 1 статьи 342 Налогового кодекса физическое лицо имеет право на применение налогового вычета по вознаграждениям. Порядок применения вычета изложен в статье 349 Налогового кодекса.

При этом, порядок определения суммы облагаемого дохода работника, согласно статье  353 Налогового кодекса, следующий:

сумма доходов работника, подлежащих налогообложению у источника выплаты, начисленных за налоговый период,

минус

сумма корректировки дохода за налоговый период, предусмотренной пунктом  1 статьи 341 Налогового кодекса,

минус

сумма налоговых вычетов в порядке, указанном в статье 342 Налогового кодекса.

Учитывая вышеизложенное, вычеты по вознаграждениям применяются к совокупной сумме начисленных доходов за месяц. То есть, в месяцы начисления бонусов, сумма вычетов применяется к общей сумме  начисленной заработной платы и бонусов.